基寡糖素的作用機理主要有三點：
1、氨基寡糖素可以誘導作物產(chǎn)生一種幾丁質(zhì)酶來分解吸收線蟲和卵殼中的殼寡糖使線蟲體壁和卵殼溶解掉，從而導致線蟲和蟲卵死亡，提前和經(jīng)常在作物上使用氨基寡糖素可誘導幾丁質(zhì)酶的數(shù)量長時間保持在較高水平，達到預防線蟲的目的。
2、氨基寡糖素施入土壤后，能在短時間內(nèi)培養(yǎng)起大量的放線菌等有益菌群，這些有益菌群分泌出的大量抗生素類物質(zhì)和抗性酶（幾丁質(zhì)酶等）可直接抑制線蟲和蟲卵，同時抑制腐霉菌、疫霉菌、絲核菌、尖鐮孢菌、霉菌、鐮刀菌等有害菌群，從而減輕因線蟲危害造成的有害菌的復合侵染，減輕“死棵”。
3、氨基寡糖素具有強大的生根養(yǎng)根作用，促進根系細胞的分生，使毛細根快速增多，減少漚根、死根和腐爛根的出現(xiàn)，促使根系發(fā)達。因此當作物在生長或結(jié)果盛期出現(xiàn)線蟲危害時，通過灌根處理可以使作物重新恢復生機，保持正常生長狀態(tài)，因此能夠?qū)⒕�蟲危害帶來的損失降到較低，該產(chǎn)品防治死棵子的原理是產(chǎn)生大量的放線菌，從而讓死棵子的病菌無處插足。大量的氨基寡糖素刺激作物生根壯根，增強作物抵抗力，從而加強吸收，達到豐產(chǎn)豐收。還對白粉虱有顯著的抑制作用，原理還是對白粉虱的卵有鏟除作用。